Les biodiversité peut donc se décliner à différents niveaux:
- au niveau de la diversité des écosystèmes (exemples: une cours de récréation, un jardin, un bord de route, un champs, une forêt, un lac,... et leurs habitants),
un écosystème se définit par un milieu et les formes de vie qui peuplent ce milieu
- au niveau de la diversité des espèces (exemples : les habitants des champs, de la forêt, du lac,...),
- au niveau de la diversité des individus au sein d'une espèce (exemple: escargot commun: Cepaea),
Cette biodiversité est aussi étudiée au cours du temps avec la reconstitution d'écosystèmes anciens à partir de fossiles (exemple: une forêt marécageuse du Carbonifère datée de 300Ma).
Pour chaque niveau, on peut chercher à quantifier cette diversité et chercher à expliquer ce qui la caractérise, son origine.