Les expériences réalisées avec des enzymes et leurs substrats ont permis de conclure à la double spécificité des enzymes et à la formation de complexes enzymes-substrat.

             Le logiciel Rastop ou Libmol permet de modéliser ces complexes

             - Fichier pdb de l’Amylase pancréatique porcine en complexe avec des molécules d'amidon

             L'amylase est une enzyme qui hydrolyse les liaisons entre les molécules de glucose des chaînes formant l'amidon. Les produits de cette hydrolyse sont principalement des molécules de maltose (formées de deux unités glucose) et le restant de la molécule d'amidon de nouveau utilisé comme substrat par l'enzyme.

Selon les auteurs de ce modèle:
- les acides aminés impliqués dans l'hydrolyse sont Asp197, Asp300, Glu233.
-  les acides aminés 305 à 310 forment une boucle qui serait impliquée dans la libération du maltose produit par l'hydrolyse.

Rappel:
- les enzymes sont des protéines,
- l'amidon est un polymère de glucoses appelés GLC dans le script.
 

 Les fichiers « .pdb » s’ouvrent avec:
- le logiciel Rastop téléchargeable en cliquant sur ce lien.
- le logiciel libmol disponible en ligne en cliquant sur ce lien.

Fiche technique rastop.
Fiche technique libmol.